運行中要檢查管路及各有關閥門的開啟情況，其中進水閥、出水閥、進氣閥、出液閥、均壓閥、安全檢查閥前的截止閥和液面批示器的閥門必須全開，放油閥和放空氣閥應關閉。同時應注意，冷凝壓力一般不超過1.5Mpa，對于氨壓縮機應定期采用化學分析法或酚酞試紙檢驗冷卻水是否含氨，以確定冷凝器是否漏氨，一般每月一次，發現問題及時處理。

   石墨冷凝器滿足市場，創造市場，石墨冷凝器正常運行時，應先開啟風機、然后是循環水泵，再開啟進氣閥和出液閥。噴水嘴應暢通，定期清除水垢，應經常檢查石墨冷凝器冷卻水的供應情況或風機的風量情況，保證水量或風量足夠，分配均勻。冷凝器的進出水溫差應根據冷凝器種類調整蒸發式冷凝器通常控制在8-14℃，立式或淋激式2-3℃，臥式為4-6℃，冷凝溫度較出水溫度高3-5℃，根據水質情況，定期除水垢，水垢厚度一般不得超過1.5mm，一般一年清除一次。當石墨冷凝器停止工作時，應首先關閉進氣閥，間隔一段時間后，再切斷水泵和風機的電源，停止供水，冬季應將臥式、組合式石墨冷凝器中的積水放凈，若石墨冷凝器長時間停用，須將制冷劑排空，并與其他管路隔開。